Вновь открытые вирусы зачастую обладают уникальными механизмами заражения, а структуры некоторых их биологических молекул не имеют аналогов даже среди представителей тех же семейств. Поэтому при изучении таких вирусов важно выполнить комплексное структурное исследование их белков. Такую задачу поставили перед собой молодые ученые «Вектора» в работах, представленных на конференции «Biomembranes-2024».
Стендовый доклад старшего научного сотрудника, к.б.н. Анастасии Гладышевой «Model of the recently discovered orthonairoviruses ribonucleoprotein complex formation and future prospects» был посвящен исследованию рибонуклеопротеиновых комплексов недавно обнаруженных ортонайровирусов Yezo virus, Songling virus и Beiji nairovirus. В представленной работе авторам удалось получить и проанализировать модели гексамерных комплексов нуклеопротеинов данных вирусов. Для дальнейших исследований и расшифровки структуры методом рентгеноструктурного анализа были получены рекомбинантные нуклеопротеины всех трех вирусов.
Одним из недавно обнаруженных, но представляющих большой интерес вирусов является вирус Хасеки (Haseki tick virus). Биоинформатическому анализу структуры и функций отдельных его белков посвящены работы «A structural approach to identify the first protein encoded by the Haseki tick virus genome», представленная исследователем Ириной Осинкиной, и «Design of the Helicase of the novel Haseki tick virus and its structural and functional analysis in AlphaFold3», представленная Никитой Радченко.
В работе Ирины Осинкиной были получены модели первого структурного белка, закодированного в полипротеине вируса Хасеки, и произведено его аналитическое сравнение с известными структурными белками представителей семейства Flaviviridae. В работе стажера-исследователя Никиты Радченко с помощью нейросети AlphaFold3 были впервые получены модели предполагаемой геликазы вируса Хасеки и проведено ее сравнение с известными структурами геликаз известных вирусов.
Краеугольным камнем молекулярной вирусологии является изучение роли нетранслируемых регионов вирусной РНК в жизненном цикле вирусов. Доклад стажера-исследователя Дарьи Алхиреенко «Complex of Kindia tick virus untranslated RNA regions with phage MS2 coat protein in structural RNA research» был посвящен комплексному подходу для изучения вторичной структуры РНК недавно обнаруженного сегментированного вируса Kindia tick virus.
Для справки: Международная научная конференция «Biomembranes-2024» проходила с 7 по 11 октября в г. Долгопрудный. Организаторами мероприятия выступили Центр исследований молекулярных механизмов старения и возрастных заболеваний Московского физико-технического института и институт iHuman (Шанхай, Китай).
